SCI-referierte Publikation 2010
Shams KM, Tichy G, Fischer A, Sager M, Peer T, Bashar A & K Filip (2010): Aspects of phytoremediation for chromium contaminated sites using common plants Urtica dioca, Brassica napus and Zea mays. – Plant Soil 328: 175-189. 
SCI-referierte Publikation 2009
1. Jozic Marija, Peer Thomas & Hans Malissa (2009): Rapid test methods for the field screening of heavy metals in soil samples. Water, Air and Soil Pollution 199: 291-300.
2. Shams Kahled Muhamed, Tichy Gottfried, Sager Manfred, Peer Thomas, Bashar Asthar, & Marija Jozic (2009): Soil contamination from tannery wastes with emphasis on the fate and distribution of tri- and hexavalent Chromium. Water, Air and Soil Pollution 199: 123-137. 
3. Jozic Marija, Peer Thomas & Roman Türk (2009) The impact of the tunnel exhausts in terms of heavy metals to the surrounding ecosystem. Environ. Monit, Assess. 150: 261-271. 
SCI-referierte Publikation 2006 und 2007
Peer, T. Gruber, J.P., Millinger, A. & F. Hussain (2007) Phytosociology, structure and diversity of the steppe vegetation in the mountains of Northern Palkistan. – Phytocoenologia, 37/1: 1-65.
Lettner, H., Griesebner, A., Peer, T., Hubmer AK & M. Pintaric (2006) Altitude dependent 137Cs concentrations in different plant species in alpine agricultural areas. In: Journal of Environmental Radioactivity, 86: Elsevier, 12-30
weitere Publikationen
Peer, T. (1993): Die Föhrenwälder in Südtirol in ihren räumlichen und ökologischen Beziehungen. Dissertationes Botanicae 196 (Festschrift ZOLLER), 191-208.
Peer, T. und M. Pintaric (1994): Das Verhalten von Radiocäsium in Weiderasen der Hohen Tauern (Salzburg, Austria). Verh. Ges. f. Ökologie 23, 105-111. 
Gstöttner, E. und T. Peer (1995): Schwermetalluntersuchung in Hochmooren des Bundeslandes Salzburg. Bundesministerium für Umwelt, Bd. 20, Schriftenreihe der Sektion I, Wien, 63 S. 
Peer, T. (1995): Die natürliche Pflanzendecke Südtirols. Begleittext und Karte der natürlichen Vegetation 1:200.000. Autonome Provinz Bozen-Südtirol, 32
S.  Stemmer, M. und T. Peer (1996): Untersuchungen zum Nährstoffhaushalt beweideter und nicht mehr beweideter Almflächen im Sonderschutzgebiet Piffkar (Nationalpark Hohe Tauern). Wiss. Mitt. Aus dem NP Hohe Tauern, 2, 7-17. 
Peer, T. (2000): The Highland Steppes of the Hindu Kush Range as Indicators of Centuries Old Pasture Farming. Marburger Geographische Schriften 135, 312 – 325. 
Peer, T., Millinger, A., Gruber J. P. und F. Hussain (2001): Vegetation and altitudinal zonation in relation to the impact of grazing in the steppe lands of the Hindu Kush Range (N-Pakistan): Phytocoenologia 31, 477-498. 
Köck, A. und T. Peer (2001): Experimentelle Untersuchungen an einer papierchromatographischen Methode zur Rotteindikation von Komposten. Ber. nat.-med. Ver. Salzburg 13, 7-26. 
Peer, T., Lippert, W., Wunder H. & J. Seidenschwarz (2003): Die Pflanzenwelt des Nationalparks Berchtesgaden. Berchtesgadener Anzeiger, Berchtesgaden, 192 S. 
Hartl, H und T. Peer (2005): Die Pflanzenwelt im Nationalpark Hohe Tauern. 2., völlig überarbeitete und aktualisierte Auflage. Universitätsverlag Carinthia, Klagenfurt.